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8月5日,在2022阿里云生命迷信与智能盘算峰会上,阿里云高功能盘算研发卖力人何万青公布了《生命迷信行业云上办理方案及最佳理论》白皮书,同时推出高功能容器、大内存、高IO等三大高功能盘算办理方案,满意基因测序与AI制药范畴中海量级数据剖析、作业流程与情况各别等场景需求。

生命迷信行业开展至今,早已离不开高功能盘算(High Performance Computing)的帮助,从盘算机帮助药物设计、疫苗研发,到经过基因检测提供精准医疗办事、产前筛查等,高功能盘算HPC在生命迷信研讨中饰演着非常紧张的脚色。

随着云盘算技能办事及理论的日趋成熟,越来越多的行业经过上云完成了整个财产的转型晋级,正处于黄金时期的生命迷信行业也不破例。但是,现在针对生命迷信行业的办理方案大局部都为线下IDC超算集群方案,随着基因组学、生物制药技能的不停演进及盘算机迷信的不停开展,传统盘算机集群资源已无法满意生命迷信行业及技能演进的需求。

本次公布的《生命迷信行业云上办理方案及最佳理论》白皮书指出,生命迷信企业的 IT 底子办法次要面对资源范围牢固、建立周期长和硬件资源运维本钱高三大题目。同时生命迷信行业也盼望拥抱大众云架构、利用异构盘算与人工智能等新技能。

何万青表现,云上高功能盘算是现在HPC建立利用的最佳途径。

在原来大众云与混淆云两大办理方案的底子上,针对生命迷信行业的差别需求,阿里云在该白皮书中新公布了高功能容器、大内存、高IO等三大高功能盘算办理方案,合计五大办理方案:

1.大众云办理方案:提供一套通用的大众云架构的办理方案,满意用户疾速便捷利用云上 HPC 办事的需求,并基于商业的岑岭和低谷静态举行盘算资源的弹性扩缩容,无效节流商业本钱。方案尤其实用于疾速开展的生命迷信企业。

2.混淆云架构办理方案:局部企业拥有线下 IDC 数据中心,但底子办法偏旧。随着商业的疾速增加,盼望可以利用阿里云 E-HPC 提供的微弱新算力,同时利旧IDC数据中心资源。这种状况可用混淆云架构一致办理云上云下资源,与大众云买通,支持弹性扩缩容。企业可按需选择办理节点设置在云上或云下。

3.HPC+AI 的高功能容器方案:实用于药物研发和商业流程庞大多样的生信商业,触及使用版本浩繁、依赖情况庞大,差别的事情流大概基于差别的操纵体系和编译器构建。阿里云E-HPC高功能容器使用eStack可让利用多种软件栈的生信使用运转在统一个平台,便捷办理,支持多种调理器和底层资源,兼容性十分高。

4.生信行业使用大内存办理方案:阿里云与互助同伴 Memverge 团结推出,实用于必要举行海量数据剖析的商业,如基因测序中每个细胞的表达量数据高达数十万条读取 (reads),这种海量级的数据剖析必要大内存容量。利用摆设 MemVerge Memory Machine 软件的 ECS i4p 实例作为盘算节点,可满意商业对功能的极致要求,同时阿里云E-HPC可主动纳管一切节点。

5.生信行业使用高 IO 办理方案:基因构造学研讨发生的数据增加疾速且需永世保管,要求存储体系具有海量容量及高扩展性。别的,基因研讨使用软件品种浩繁,局部盘算义务对 IO 吞吐要求很高。对此,阿里云与互助同伴联科团体团结推出生信行业使用高 IO 办理方案。

上述办理方案可以掩盖生命迷信行业的绝大少数场景与需求,拥有掩盖环球的丰厚算力,极致功能,弹性伸缩才能协助客户降本提效,管控可视化协助用户省心运维等上风。现在,阿里云高功能盘算普遍使用于产业仿真(CAD/CAE)、芯片设计(EDA)、生物医药质料、动力勘察与大众办事等多个行业。

深势科技使用弹性供给的本钱优化战略,联合抢占式实例的代价,以30%的本钱完成海量资源的交付。同时云上弹性高功能盘算E-HPC主动运维的特征,低落了深势科技的运维本钱,提拔了集群办理服从。

生命医学企业圣庭医疗经过上云优化了传统IDC集群的数据牢靠性、运维本钱及服从题目,基因比对与剖析服从提拔了70%。阿里云高功能盘算团队还经过联合Slurm商业事情流dependency与主动伸缩的联合,增加了有效的盘算资源糜费,无效低落了利用本钱。

在本次峰会上,天池大赛-“创新大家杯冷冻电镜卵白质布局建模大赛”颁奖仪式也同期举行,环球近2000名参赛者一同探究云盘算与卵白质研讨的前沿课题,大赛全程从阿里云E-HPC平台、英特尔第三代至强可扩展处置器(Cooper Lake)、深度学习减速和加强型AVX-512指令集等软硬件联合的角度举行全程领导和训练,推进全行业对人才培育的继续存眷。


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